ایتھوپیا میں SARS-CoV-2 کی شناخت کے لیے چار نیوکلک ایسڈ ایمپلیفیکیشن اسسیس کی کارکردگی

Nature.com پر جانے کا شکریہ۔آپ محدود سی ایس ایس سپورٹ کے ساتھ براؤزر کا ورژن استعمال کر رہے ہیں۔بہترین تجربے کے لیے، ہم تجویز کرتے ہیں کہ آپ ایک اپ ڈیٹ شدہ براؤزر استعمال کریں (یا انٹرنیٹ ایکسپلورر میں مطابقت موڈ کو غیر فعال کریں)۔اس کے علاوہ، جاری تعاون کو یقینی بنانے کے لیے، ہم سائٹ کو بغیر اسٹائل اور جاوا اسکرپٹ کے دکھاتے ہیں۔
ایک ساتھ تین سلائیڈوں کا ایک carousel دکھاتا ہے۔ایک وقت میں تین سلائیڈوں سے گزرنے کے لیے پچھلے اور اگلے بٹنوں کا استعمال کریں، یا ایک وقت میں تین سلائیڈوں سے گزرنے کے لیے آخر میں سلائیڈر بٹن استعمال کریں۔
2019 کے کورونا وائرس کی بیماری (COVID-19) کے پھیلنے کے بعد سے، دنیا بھر میں بہت سے تجارتی نیوکلک ایسڈ ایمپلیفیکیشن ٹیسٹ (NAATs) تیار کیے گئے ہیں اور معیاری اسیس بن چکے ہیں۔اگرچہ بہت سے ٹیسٹ تیزی سے تیار کیے گئے اور لیبارٹری تشخیصی ٹیسٹوں پر لاگو کیے گئے، ان ٹیسٹوں کی کارکردگی کا مختلف ترتیبات میں جائزہ نہیں لیا گیا ہے۔لہذا، اس مطالعے کا مقصد جامع حوالہ معیار (CRS) کا استعمال کرتے ہوئے Abbott SARS-CoV-2، Daan Gene، BGI، اور Sansure Biotech Asses کی کارکردگی کا جائزہ لینا تھا۔یہ مطالعہ ایتھوپیا کے پبلک ہیلتھ انسٹی ٹیوٹ (EPHI) میں 1 سے 30 دسمبر 2020 تک کیا گیا تھا۔ QIAamp RNA منی کٹ اور ایبٹ DNA نمونے کی تیاری کے نظام کا استعمال کرتے ہوئے 164 nasopharyngeal نمونے نکالے گئے تھے۔164 نمونوں میں سے، 59.1% مثبت تھے اور 40.9% CRS کے لیے منفی تھے۔ سی آر ایس (پی <0.05) کے مقابلے سنسور بائیوٹیک کی مثبتیت نمایاں طور پر کم تھی۔ سی آر ایس (پی <0.05) کے مقابلے سنسور بائیوٹیک کی مثبتیت نمایاں طور پر کم تھی۔ Положительные результаты Sansure Biotech были значительно ниже по сравнению с CRS (p <0,05)۔ سنسور بائیوٹیک کے مثبت نتائج CRS (p <0.05) کے مقابلے میں نمایاں طور پر کم تھے۔与CRS 相比，Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p <0.05）۔与CRS 相比，Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p <0.05）۔ У Sansure Biotech было значительно меньше положительных результатов по сравнению с CRS (p <0,05)۔ Sansure Biotech کے CRS (p <0.05) کے مقابلے میں نمایاں طور پر کم مثبت نتائج تھے۔چار تجزیوں کا مجموعی معاہدہ CRS کے مقابلے میں 96.3–100% تھا۔Sansure Biotech پرکھ کی کم مثبت شرح کے علاوہ، چاروں پرکھوں کی کارکردگی تقریباً موازنہ تھی۔اس طرح، Sansure Biotech [Research Only (RUO)] پرکھ کو ایتھوپیا میں اس کے استعمال کے لیے اضافی توثیق کی ضرورت ہے۔آخر میں، مناسب مینوفیکچرر کے دعووں کے ساتھ اسسیس کا اندازہ کرنے کے لیے اضافی تحقیق پر غور کیا جانا چاہیے۔
لیبارٹری ٹیسٹنگ ورلڈ ہیلتھ آرگنائزیشن (WHO) کے اسٹریٹجک پلان برائے کورونا وائرس بیماری 2019 (COVID-19) تیاری اور ردعمل (SPRP) کا حصہ ہے۔ڈبلیو ایچ او نے مشورہ دیا ہے کہ ممالک کو تیاری، مناسب کیس مینجمنٹ، چوکسی اور صحت عامہ کے چیلنجوں کے لیے تیز رفتار ردعمل کو بہتر بنانے کے لیے لیبارٹری کی صلاحیت پیدا کرنے کی ضرورت ہے۔اس سے پتہ چلتا ہے کہ ابھرتے ہوئے متعدی ایجنٹوں کی بیماری اور وبائی امراض کی خصوصیت اور ان کے پھیلاؤ کو کنٹرول کرنے میں لیبارٹری کا کردار کلیدی ہے۔
COVID-19 کی تشخیص کے لیے وبائی امراض اور طبی معلومات، ذاتی علامات/علامات، اور ریڈیوگرافک اور لیبارٹری ڈیٹا2 کی ضرورت ہوتی ہے۔چین کے ووہان میں COVID-19 پھیلنے کی اطلاع کے بعد سے، دنیا بھر میں بہت سے تجارتی نیوکلک ایسڈ ایمپلیفیکیشن ٹیسٹ (NAATs) تیار کیے گئے ہیں۔ریئل ٹائم ریورس ٹرانسکرپشن پولیمریز چین ری ایکشن (rRT-PCR) کو شدید ایکیوٹ ریسپائریٹری سنڈروم 2 (SARS-CoV-2)3 انفیکشن کی لیبارٹری تشخیص کے لیے ایک معمول اور معیاری طریقہ کے طور پر استعمال کیا گیا ہے۔SARS-CoV-2 کی مالیکیولر شناخت عام طور پر ORF1a/b (اوپن ریڈنگ فریم 1a/b) میں N (نیوکلیو کیپسڈ پروٹین جین)، E (لفافہ پروٹین جین) اور RdRp (RNA پر منحصر RNA پولیمریز جین) پر مبنی ہوتی ہے۔ .جین) وائرل جینوم سے شناخت شدہ خطہ۔انہیں وائرس کی شناخت کے لیے وائرل جینومز میں پائے جانے والے اہم محفوظ خطوں میں شمار کیا جاتا ہے۔ان جینوں میں، RdRp اور E جینز میں اعلی تجزیاتی پتہ لگانے کی حساسیت ہوتی ہے، جب کہ N جین میں کم تجزیاتی حساسیت ہوتی ہے۔
پی سی آر اسسیس کی کارکردگی مختلف عوامل کی بنیاد پر مختلف ہو سکتی ہے جیسے: ایکسٹرکشن ریجنٹس، ایمپلیفیکیشن/ڈیٹیکشن ری ایجنٹس، نکالنے کا طریقہ، پی سی آر مشین کا معیار اور دیگر آلات۔اپریل 2020 تک، نو ممالک سے 48 سے زیادہ مختلف تشخیصی آلات کو COVID-196 کی تشخیص کے لیے ہنگامی استعمال کی اجازت (EUA) موصول ہوئی ہے۔ایتھوپیا میں، 14 سے زیادہ ریئل ٹائم پی سی آر پلیٹ فارمز SARS-CoV-2 کے PCR کا پتہ لگانے کے لیے 26 عوامی صحت کے اداروں میں استعمال کیے جاتے ہیں، بشمول ABI 7500، Abbott m2000، Roche 48000 اور Quant-studio7۔اس کے علاوہ، مختلف PCR ٹیسٹ کٹس دستیاب ہیں، جیسے Daan Gene ٹیسٹ، Abbott SARS-CoV-2 ٹیسٹ، Sansure Biotech ٹیسٹ، اور SARS-CoV-2 BGI ٹیسٹ۔اگرچہ rRT-PCR انتہائی حساس ہوتا ہے، لیکن COVID-19 کے کچھ مریض غلط جمع کرنے، نقل و حمل، ذخیرہ کرنے اور ہینڈلنگ اور لیبارٹری ٹیسٹنگ کی وجہ سے نمونوں میں وائرل رائبونیوکلک ایسڈ (RNA) کی ناکافی کاپیوں کی وجہ سے غلط منفی نتائج کی اطلاع دیتے ہیں۔اہلکاروں کے حالات اور اعمال 8۔اس کے علاوہ، نمونہ یا کنٹرول میں غلط استعمال، سائیکل تھریشولڈ (Ct) کی ترتیب، اور دوسرے پیتھوجینک نیوکلک ایسڈز یا غیر فعال/بقیہ SARS-CoV-2 RNA کے ساتھ کراس ری ایکٹیویٹی rRT-PCR9 اسسیس میں غلط مثبت نتائج کا باعث بن سکتی ہے۔اس طرح، یہ واضح ہے کہ پی سی آر ٹیسٹ واقعی جین کے ٹکڑوں کے کیریئرز کی شناخت کر سکتے ہیں، کیونکہ وہ حقیقی طور پر فعال وائرل جینز کے درمیان فرق بھی نہیں کر سکتے، اس لیے ٹیسٹ صرف کیریئرز کی شناخت کر سکتے ہیں نہ کہ مریض10۔لہذا، ہماری ترتیب میں معیاری طریقوں کا استعمال کرتے ہوئے تشخیصی کارکردگی کا جائزہ لینا ضروری ہے۔اگرچہ بہت سے NAAT ری ایجنٹس ایتھوپیا کے پبلک ہیلتھ انسٹی ٹیوٹ (EPHI) اور پورے ملک میں دستیاب ہیں، ان کی تاثیر کا کوئی تقابلی جائزہ ابھی تک رپورٹ نہیں کیا گیا ہے۔لہذا، اس مطالعے کا مقصد طبی نمونوں کا استعمال کرتے ہوئے rRT-PCR کے ذریعے SARS-CoV-2 کا پتہ لگانے کے لیے تجارتی طور پر دستیاب کٹس کی تقابلی کارکردگی کا جائزہ لینا تھا۔
اس مطالعہ میں مشتبہ COVID-19 کے ساتھ کل 164 شرکاء کو شامل کیا گیا تھا۔زیادہ تر نمونے علاج کے مراکز سے تھے (118/164 = 72%)، جبکہ بقیہ 46 (28%) شرکاء غیر علاج مراکز سے تھے۔مرکز میں جن شرکاء کا علاج نہیں کیا گیا ان میں سے، 15 (9.1%) کے طبی طور پر مشتبہ کیسز تھے اور 31 (18.9%) میں تصدیق شدہ کیسز کے رابطے تھے۔ترانوے (56.7٪) شرکاء مرد تھے، اور شرکاء کی اوسط عمر (± SD) 31.10 (± 11.82) سال تھی۔
اس تحقیق میں، COVID-19 کے لیے چار ٹیسٹوں کی مثبت اور منفی شرحوں کا تعین کیا گیا۔اس طرح، ایبٹ SARS-CoV-2 پرکھ، Daan Gene 2019-nCoV پرکھ، SARS-CoV-2 BGI پرکھ، اور Sansure Biotech 2019-nCoV پرکھ کی مثبت شرحیں بالترتیب 59.1%، 58.5%، 57.9% اور 57.5% تھیں۔ .مثبت اور منفی جامع حوالہ معیار (CRS) کے اسکور بالترتیب 97 (59.1%) اور 67 (40.9%) تھے (ٹیبل 1)۔اس مطالعہ میں، CRS کی تعریف "کسی بھی مثبت" اصول پر مبنی تھی، جس کے تحت چار ٹیسٹ کے نتائج میں سے، ایک ہی نتیجہ دینے والے دو یا زیادہ ٹیسٹ کے نتائج کو صحیح مثبت یا منفی سمجھا جاتا تھا۔
اس مطالعہ میں، ہمیں CRS کے مقابلے میں تمام تجزیوں کے لیے 100% (95% CI 94.6–100) کا منفی فیصد معاہدہ (NPA) ملا۔سنسور بائیوٹیکنالوجی کے تجزیے نے کم سے کم پی پی اے 93.8% (95% CI 87.2-97.1) ظاہر کیا اور Daan Gene 2019-nCoV تجزیہ کا مجموعی معاہدہ 99.4% (95% CI 96.6-99.9) تھا۔اس کے برعکس، SARS-CoV-2 BGI پرکھ اور Sansure Biotech 2019-nCoV پرکھ کے درمیان مجموعی معاہدہ بالترتیب 98.8% اور 96.3% تھا (ٹیبل 2)۔
CRS اور Abbott SARS-CoV-2 پرکھ کے نتائج کے درمیان معاہدے کا کوہن کا کپا گتانک مکمل طور پر مطابقت رکھتا تھا (K = 1.00)۔اسی طرح، Daan Gene 2019-nCoV، SARS-CoV-2 BGI، اور Sansure Biotech 2019-nCoV کے ذریعے دریافت کردہ کوہن کی کپا اقدار بھی CRS (K ≥ 0.925) سے پوری طرح مطابقت رکھتی ہیں۔اس تقابلی تجزیے میں، chi-square test (McNemar test) نے ظاہر کیا کہ Sansure Biotech 2019-nCoV پرکھ کے نتائج CRS کے نتائج (p = 0.031) (ٹیبل 2) سے نمایاں طور پر مختلف تھے۔
جیسا کہ تصویر میں دکھایا گیا ہے۔1 ایبٹ SARS-CoV-2 پرکھ (مشترکہ RdRp اور N جین) کی سب سے کم Ct ویلیو (<20 Ct) کا فیصد 87.6% تھا اور Sansure Biotech 2019-nCoV پرکھ کی ORF1a/b جین Ct ویلیو نے ظاہر کیا کہ کم فیصد Ct قدر (<20 Ct) 50.3% تھی اور اعلی Ct قدر (36–40 Ct) 3.2% تھی۔ 1 ایبٹ SARS-CoV-2 پرکھ (مشترکہ RdRp اور N جین) کی سب سے کم Ct ویلیو (<20 Ct) کا فیصد 87.6% تھا اور Sansure Biotech 2019-nCoV پرکھ کی ORF1a/b جین Ct ویلیو نے ظاہر کیا کہ کم فیصد Ct قدر (<20 Ct) 50.3% تھی اور اعلی Ct قدر (36–40 Ct) 3.2% تھی۔جیسا کہ تصویر میں دکھایا گیا ہے۔1, процент наименьшего значения Ct (< 20 Ct) анализа Abbott SARS-CoV-2 (комбинированный ген RdRp и N) составил 87,6%, а значение Ct гена ORF1a/b анализа Sansure Biotech 2019-nCoV показало что процент низкого значения Ct (<20 Ct) составлял 50,3%، а высокое значение Ct (36–40 Ct) составляло 3,2%۔ 1، Abbott SARS-CoV-2 (مشترکہ جین RdRp اور N) کے سب سے کم Ct ویلیو (<20 Ct) تجزیہ کا فیصد 87.6% تھا، اور Sansure Biotech 2019-nCoV کے ORF1a/b جین تجزیہ کی Ct قدر ظاہر ہوئی۔ کہ کم Ct قدر (<20 Ct) کا فیصد 50.3 فیصد ہے، اور اعلی قدر Ct (36–40 Ct) کا حصہ 3.2% ہے۔如 图 1 所 示 ， abbott sars-cov-2 检测 （结合 结合 rdrp 和 n 基因 的 的 最 最 低 ct 值 百分比 （<20 CT） 为 87.6 ٪ ， Sansure بائیوٹیک 2019-ncov 检测 检测 的 orf1a/b 基因 ct 值 低 低 低值(<20 Ct) 的百分比为50.3%،高Ct 值(36–40 Ct) 的百分比为3.2%۔ جیسا کہ شکل 1 میں دکھایا گیا ہے، Abbott SARS-CoV-2 ٹیسٹ (RdRp اور N جین کا مجموعہ) کا سب سے کم Ct ویلیو فیصد (<20 Ct) 87.6% ہے، Sansure Biotech 2019-nCoV ٹیسٹ کی ORF1a/b جین Ct ویلیو کم Ct值(<20 Ct) % فیصد ہے 50.3%، 高Ct 值(36–40 Ct)% فیصد 3.2% ہے۔ Как показано на рисунке 1, анализ Abbott SARS-CoV-2 (сочетающий гены RdRp и N) имел самое низкое процентное значение Ct (< 20 Ct) в размере 87,6%, а значение Ct гена ORF1a/b в исследовании Sansure Biotech 2019 - اینالیز nCoV показал низкий Ct. جیسا کہ شکل 1 میں دکھایا گیا ہے، Abbott SARS-CoV-2 پرکھ (RdRp اور N جینز کو ملا کر) میں سب سے کم فیصد Ct ویلیو (<20 Ct) 87.6% تھی، جبکہ سنسور میں ORF1a/b جین کی Ct قدر بائیوٹیک 2019 کا مطالعہ - nCoV کے تجزیہ نے کم Ct ظاہر کیا۔ Процент значений (<20 Ct) составил 50,3%, а процент высоких значений Ct (36–40 Ct) 3,2%۔ اقدار کا فیصد (<20 Ct) 50.3% تھا، اور اعلی Ct اقدار کا فیصد (36–40 Ct) 3.2% تھا۔ایبٹ SARS-CoV-2 B ٹیسٹ نے Ct کی قدریں 30 سے ​​اوپر ریکارڈ کیں۔ دوسری طرف، BGI SARS-CoV-2 پرکھ پر ORF1a/b جین کی اعلی Ct ویلیو (> 36 Ct) فیصد 4% تھی (تصویر 1)۔ دوسری طرف، BGI SARS-CoV-2 پرکھ پر ORF1a/b جین کی اعلی Ct ویلیو (> 36 Ct) فیصد 4% تھی (تصویر 1)۔ С другой стороны, анализе BGI SARS-CoV-2 gen ORF1a/b имел высокое значение Ct (> 36 Ct)، процент которого составляс (%41)۔ دوسری طرف، BGI SARS-CoV-2 جین ORF1a/b کے تجزیہ میں ایک اعلی Ct ویلیو (> 36 Ct) تھی، جس کا فیصد 4% تھا (تصویر 1)۔另一方面，在BGI SARS-CoV-2 检测中，ORF1a/b 基因具有高Ct 值（> 36 Ct）的百分比为4%（弉. دوسری طرف، BGI SARS-CoV-2 کا پتہ لگانے میں، اعلی Ct ویلیو (>36 Ct) والے ORF1a/b جین کا فیصد 4% ہے (شکل 1)۔ С другой стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 PROcent genov ORF1a/b с высокиmi значениями Ct (>36 Ct) составил 4% (ris.1). دوسری طرف، BGI SARS-CoV-2 تجزیہ میں، اعلی Ct اقدار (>36 Ct) کے ساتھ ORF1a/b جینز کا فیصد 4% تھا (تصویر 1)۔
اس مطالعہ میں، ہم نے 164 nasopharyngeal نمونے لئے.تمام قسم کے اسیسز کے لیے، متعلقہ مینوفیکچررز کے تجویز کردہ طریقوں اور کٹس کا استعمال کرتے ہوئے آر این اے کی تنہائی اور امپلیفیکیشن کی گئی۔
اس تحقیق نے ثابت کیا کہ SARS-CoV-2 کے لیے ایبٹ کے ٹیسٹ میں 100% مثبت، منفی اور مجموعی طور پر ہم آہنگی کے ساتھ، CRS جیسی شناخت کی کارکردگی ہے۔کوہن کا کپا معاہدہ 1.00 ہے، جو CRS کے ساتھ مکمل معاہدے کی نشاندہی کرتا ہے۔امریکہ میں واشنگٹن یونیورسٹی کی اسی طرح کی ایک تحقیق سے پتا چلا ہے کہ SARS-CoV-2 کے لیے ایبٹ ٹیسٹ کی مجموعی حساسیت اور خصوصیت بالترتیب 93% اور 100% تھی، CDC کی لیبارٹری سے طے شدہ پرکھ (LDA) کے مقابلے۔ .11. Abbott SARS-CoV-2 کا پتہ لگانے کا نظام N اور RdRp جینز کی بیک وقت مشترکہ کھوج پر مبنی ہے، کیونکہ دونوں جین زیادہ حساس ہیں، غلط منفی کو کم کرتے ہیں12۔ویانا، آسٹریا میں ہونے والی ایک تحقیق نے یہ بھی ظاہر کیا کہ بڑے نکالنے کے نمونے کے حجم اور پتہ لگانے والی ایلیونٹ والیوم نے کم کرنے کے اثرات کو کم کیا اور پتہ لگانے کی کارکردگی میں اضافہ کیا۔اس طرح، SARS-CoV-2 پرکھ کے لیے ایبٹ کا کامل مماثلت پلیٹ فارم کا پتہ لگانے کے نظام سے منسلک کیا جا سکتا ہے جو بیک وقت امتزاج جینز کا پتہ لگاتا ہے، بڑی تعداد میں نمونے (0.5 ملی لیٹر) نکالتا ہے، اور بڑی مقدار میں ایلیونٹ (40 μl) استعمال کرتا ہے۔
ہمارے نتائج نے یہ بھی ظاہر کیا کہ ڈان جینیاتی ٹیسٹ کی کھوج کی کارکردگی تقریباً سی آر ایس جیسی ہی تھی۔یہ ہوانان، چین میں Anhui یونیورسٹی میں کی گئی ایک تحقیق 14 اور مینوفیکچرر کے 100% مثبت معاہدے کے دعوے سے مطابقت رکھتا ہے۔مسلسل نتائج کی اطلاعات کے باوجود، ایک ہی ایلیویٹ کو دوبارہ جانچنے کے بعد ایک نمونہ غلط منفی تھا، لیکن ایبٹ SARS-CoV-2 اور Sansure Biotech nCoV-2019 اسسیس میں مثبت تھا۔اس سے پتہ چلتا ہے کہ مختلف قسم کے اسیس کے نتائج میں تغیر ہو سکتا ہے۔ بہر حال، چائنا 15 میں کی گئی تحقیق میں، ڈان جین پرکھ کا نتیجہ ان کے لیب سے طے شدہ حوالہ پرکھ کے مقابلے میں نمایاں طور پر مختلف (p <0.05) تھا۔ بہر حال، چائنا 15 میں کی گئی تحقیق میں، ڈان جین پرکھ کا نتیجہ ان کے لیب سے طے شدہ حوالہ پرکھ کے مقابلے میں نمایاں طور پر مختلف (p <0.05) تھا۔ Тем не менее, в исследовании, проведенном в Китае15, результат анализа Daan Gene значительно отличался (p < 0,05) от от. تاہم، China15 میں ہونے والی ایک تحقیق میں، ڈان جین کے تجزیہ کا نتیجہ ان کے لیبارٹری حوالہ جات کے تجزیہ سے نمایاں طور پر مختلف (p <0.05) تھا۔然而，在中国进行的研究中15，大安基因检测的结果与其实验室定义的参考室定义的参考室定义的参考室定义的参室然而，在中国进行的研究中15，大安基因检测的结果与其实验室定义的参考室定义的参考检测縭15 Однако в исследовании, проведенном в Китае15, результаты генетического теста Daan значительно отличались (p < 0,05) صفحہ اول تاہم، China15 میں ہونے والی ایک تحقیق میں، ڈان کے جینیاتی ٹیسٹ کے نتائج اس کے حوالہ لیبارٹری ٹیسٹ کے مقابلے میں نمایاں طور پر مختلف (p <0.05) تھے۔یہ تفاوت SARS-CoV-2 کا پتہ لگانے کے لیے ریفرنس ٹیسٹ کی حساسیت کی وجہ سے ہو سکتا ہے، اور وجہ کا تعین کرنے کے لیے مزید مطالعات اہم ہو سکتی ہیں۔
اس کے علاوہ، ہمارے مطالعے نے CRS کے ساتھ SARS-CoV-2 BGI پرکھ کی تقابلی کارکردگی کا جائزہ لیا، جس میں بہترین مثبت فیصد معاہدہ (PPA = 97.9%)، منفی فیصد کا معاہدہ (NPA = 100%)، اور صنف کے لحاظ سے مجموعی فیصد کا معاہدہ دکھایا گیا ہے۔ او پی اے)۔)۔= 98.8%)۔کوہن کی کاپا کی اقدار نے اچھا معاہدہ ظاہر کیا (K = 0.975)۔نیدرلینڈ 16 اور چین 15 میں ہونے والے مطالعات نے مستقل نتائج دکھائے ہیں۔SARS-CoV-2 BGI ٹیسٹ ایک واحد جین (ORF1a/b) کا پتہ لگانے کا ٹیسٹ ہے جس میں 10 μl ایمپلیفیکیشن/ڈیٹیکشن ایلویٹ کا استعمال کیا جاتا ہے۔ہمارے حوالہ کے نتائج کے ساتھ اچھے شماریاتی معاہدے کے باوجود، تجزیے میں کل نمونے کے دو مثبت نمونے (1.22%) چھوٹ گئے۔اس کے مریض اور کمیونٹی دونوں سطحوں پر ٹرانسمیشن کی حرکیات کے لیے بہت بڑے طبی اثرات ہو سکتے ہیں۔
اس مطالعے میں شامل ایک اور تقابلی تجزیہ Sansure Biotech nCoV-2019 rRT-PCR (RUO) پرکھ تھا۔میچ کا مجموعی تناسب 96.3% تھا۔معاہدے کی طاقت کا تعین بھی کوہن کی کپا ویلیو سے کیا گیا، جو کہ 0.925 تھی، جو کہ CRS کے ساتھ مکمل معاہدے کی نشاندہی کرتی ہے۔ایک بار پھر، ہمارے نتائج چین کے چانگشا میں سنٹرل ساؤتھ یونیورسٹی اور لیوژو پیپلز ہسپتال، لیوزو سٹی، چائنا17 کے کلینیکل لیبارٹری ڈیپارٹمنٹ میں کیے گئے مطالعات سے ملتے جلتے ہیں۔ اگرچہ مندرجہ بالا اچھی شماریاتی ہم آہنگی ریکارڈ کی گئی تھی، chi-square test (MacNemar test) نے ظاہر کیا کہ Sansure Biotech پرکھ کے نتیجے میں CRS (p <0.005) کے مقابلے میں شماریاتی لحاظ سے اہم فرق آیا ہے۔ اگرچہ مندرجہ بالا اچھی شماریاتی ہم آہنگی ریکارڈ کی گئی تھی، chi-square test (MacNemar test) نے ظاہر کیا کہ Sansure Biotech پرکھ کے نتیجے میں CRS (p <0.005) کے مقابلے میں شماریاتی لحاظ سے اہم فرق آیا ہے۔ Несмотря на то, что было зафиксировано указанное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Макнемара) показал, что результат анализа Sansure Biotech имеет статистически значимое различие по сравнению с CRS (p < 0,005). اگرچہ اوپر اچھا شماریاتی معاہدہ ریکارڈ کیا گیا تھا، chi-square test (McNemar test) نے ظاہر کیا کہ Sansure Biotech پرکھ کے نتیجے میں CRS (p <0.005) کے مقابلے میں شماریاتی لحاظ سے اہم فرق تھا۔尽管 记录 上述 上述 良好 的 统计 一致性 ， 但 卡方 检验 （（（（（， ， ， ， ， ， ， ， ， ， ， ， 与 相比 具有 统计学 显着 差异 差异 （（P <0.005）。。。尽管 记录 上述 上述 良好 良好 统计 性 ， 但 检验 （（（（（， ， ， ， ， ， ， ， ， ， ， ， ， ， ， ， ， ， ， ， 具有 显着 （（（P <0.005 。。。。。。。。。。。。。。。。 ….))) Несмотря на отмеченное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Макнемара) показал статистически значимую разницу (p < 0,005) между анализом Sansure Biotech и CRS. اوپر بیان کیے گئے اچھے شماریاتی معاہدے کے باوجود، chi-square test (McNemar test) نے Sansure Biotech پرکھ اور CRS کے درمیان شماریاتی لحاظ سے اہم فرق (p <0.005) ظاہر کیا۔چھ نمونے (3.66%) CRS (ضمنی جدول 1) کے مقابلے میں غلط منفی پائے گئے۔یہ بہت اہم ہے، خاص طور پر وائرس کی منتقلی کی حرکیات کے پیش نظر۔مندرجہ بالا اعداد و شمار اس کم پتہ لگانے کی شرح کو بھی سپورٹ کرتا ہے۔
اس مطالعے میں، ہر ایک پرکھ اور متعلقہ پلیٹ فارم کے لیے Ct قدروں کا تعین کیا گیا تھا، جس میں Abbott SARS-CoV-2 پرکھ میں رپورٹ کی گئی سب سے کم اوسط Ct قدر تھی۔یہ نتیجہ SARS-CoV-2 کا پتہ لگانے کے لیے ایبٹ کے بیک وقت مشترکہ جینیاتی جانچ کے نظام سے متعلق ہو سکتا ہے۔لہذا، شکل 1 کے مطابق، Abbott SARS-CoV-2 کے 87.6% نتائج کی Ct قدریں 20 سے نیچے تھیں۔ نمونے کے نتائج کی صرف ایک چھوٹی سی تعداد (12.4%) 20-30 کی حد میں تھی۔30 سے ​​اوپر کی Ct قدریں ریکارڈ نہیں کی گئیں۔ایبٹ کے SARS-CoV-2 پینل کے جینیاتی ٹیسٹنگ فارمیٹ کے استعمال کے علاوہ، یہ نتیجہ پتہ لگانے کی کم حد (32.5 RNA کاپیاں/mL) 18 سے متعلق ہو سکتا ہے، جو کمپنی کی 100 RNA کاپیوں کی نچلی حد سے تین گنا کم ہے۔ /mLملی لیٹر) 19۔
اس مطالعے کی کچھ حدود ہیں: سب سے پہلے، وسائل کی کمی کی وجہ سے ہمارے پاس معیاری/حوالہ جات کے طریقے نہیں ہیں [جیسے وائرل لوڈ یا دیگر لیبارٹری ٹیسٹ (LDA)]۔دوسرا، اس مطالعے میں استعمال ہونے والے تمام نمونے nasopharyngeal swabs تھے، جبکہ نتائج دیگر نمونوں کی اقسام پر لاگو نہیں ہوتے تھے، اور تیسرا، ہمارے نمونے کا سائز چھوٹا تھا۔
اس مطالعہ نے SARS-CoV-2 کے لیے nasopharyngeal نمونوں کا استعمال کرتے ہوئے چار rRT-PCR اسیس کی کارکردگی کا موازنہ کیا۔سانسور بائیوٹیک پرکھ کے استثناء کے ساتھ، تمام پتہ لگانے والے اسسیس میں تقریباً موازنہ کارکردگی تھی۔ اس کے علاوہ، سی آر ایس (پی <0.05) کے مقابلے سنسور بائیوٹیک پرکھ میں کم مثبت شرح کی نشاندہی کی گئی۔ اس کے علاوہ، سی آر ایس (پی <0.05) کے مقابلے سنسور بائیوٹیک پرکھ میں کم مثبت شرح کی نشاندہی کی گئی۔ Кроме того, в тесте Sansure Biotech был выявлен низкий процент положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05)۔ اس کے علاوہ، Sansure Biotech ٹیسٹ نے CRS (p <0.05) کے مقابلے میں مثبت نتائج کا کم فیصد دکھایا۔此外،与CRS 相比، سنسور بائیوٹیک 检测的阳性率较低(p <0.05)۔此外،与CRS 相比، سنسور بائیوٹیک 检测的阳性率较低(p <0.05)۔ Кроме того, анализ Sansure Biotech имел более низкий уровень положительных результатов по сравнению с CRS (p <0,05)۔ اس کے علاوہ، سنسور بائیوٹیک پرکھ میں CRS (p <0.05) کے مقابلے میں مثبتیت کی شرح کم تھی۔Sansure Biotech nCoV-2019 (RUO) PPA، NPA اور مجموعی معاہدے کا تجزیہ 0.925 کی کوہن کاپا طاقت کے ساتھ 93.5% سے تجاوز کر گیا۔آخر میں، Sansure Biotech Assay (RUO) کو ایتھوپیا میں استعمال کے لیے مزید توثیق کی ضرورت ہے، اور انفرادی مینوفیکچررز کے دعووں کا جائزہ لینے کے لیے اضافی تحقیق پر غور کیا جانا چاہیے۔
تقابلی مطالعہ کا ڈیزائن عدیس ابابا، ایکا کوٹیبے ہسپتال، ملینیم چرچ ٹریٹمنٹ سینٹر، زیوڈیتو میموریل ہسپتال، اور سینٹ پیٹرز تپ دق کے ماہر ہسپتال میں صحت کی چار سہولیات پر کیا گیا۔اعداد و شمار 1 اور 31 دسمبر 2020 کے درمیان جمع کیے گئے تھے۔ اس مطالعے کے لیے طبی سہولیات کا انتخاب ان کے زیادہ کیسز اور شہر میں علاج کے بڑے مراکز کی دستیابی کی بنیاد پر کیا گیا تھا۔اسی طرح، آلات، بشمول ABI 7500 اور Abbott m2000 ریئل ٹائم پی سی آر آلات، NAAT ریجنٹ مینوفیکچررز کی سفارشات کے مطابق منتخب کیے گئے تھے، اور اس مطالعے کے لیے چار PCR ڈیٹیکشن کٹس کا انتخاب کیا گیا تھا، کیونکہ ایتھوپیا میں زیادہ تر لیبارٹریوں نے کم از کم استعمال کیا تھا۔ ان میں سے چارجین ٹیسٹ، ایبٹ SARS-CoV-2 ٹیسٹ، Sansure Biotech ٹیسٹ، اور SARS-CoV-2 BGI ٹیسٹ مطالعہ کے دوران کیا گیا)۔
SARS-CoV-2 کے لیے ٹیسٹنگ 1 سے 30 دسمبر 2020 تک وائرل ٹرانسپورٹ میڈیم (VTM) (Miraclean Technology, Shenzhen, China) کے 3 ملی لیٹر استعمال کرتے ہوئے ان افراد سے کی گئی جو EPHI کے حوالے کیے گئے COVID-19 کے لیے زیر تفتیش تھے۔Nasopharyngeal نمونے تربیت یافتہ نمونے جمع کرنے والوں کے ذریعہ جمع کیے گئے اور ٹرپل پیک میں EPHI کو بھیجے گئے۔نیوکلک ایسڈ کی تنہائی سے پہلے، ہر نمونے کو ایک منفرد شناختی نمبر تفویض کیا جاتا ہے۔دستی اور خود کار طریقے سے نکالنے کے طریقوں کا استعمال کرتے ہوئے پہنچنے پر فوری طور پر ہر نمونے سے نکالا جاتا ہے۔اس طرح، ایبٹ ایم 2000 کے خود کار طریقے سے نکالنے کے لیے، ہر نمونے سے 1.3 ملی لیٹر (بشمول 0.8 ملی لیٹر ڈیڈ والیوم اور 0.5 ملی لیٹر ایکسٹرکشن انلیٹ والیوم) نکالا گیا اور اسے ایبٹ ڈی این اے سیمپل پریپریشن سسٹم (ایبٹ مالیکیولر انکارپوریشن ڈیس پلینز، ایبٹ مالیکیولر انکارپوریشن) سے گزارا گیا۔ IL، USA)۔اصل وقت میں SARS-CoV-2 (EUA) کے دو راؤنڈز کے مجموعی عمل (بازیافت اور پتہ لگانے) میں 96 [92 نمونے، دو پتہ لگانے والے کنٹرول اور دو نان ٹیمپلیٹ کنٹرولز (NTC)] کا ایک بیچ شامل تھا۔کان کنی.اسی طرح، دستی نکالنے کے لیے، وہی نمونے استعمال کریں (خودکار نکالنے اور دریافت کے لیے)۔اس طرح، پورے عمل کے دوران، 140 µl نمونے QIAamp وائرل RNA Mini Kit (QIAGEN GmbH، Hilden، Germany) کا استعمال کرتے ہوئے 24 کے بیچوں میں (بشمول 20 نمونے، دو پرکھ کے کنٹرول اور دو NTCs) نو راؤنڈز میں نکالے گئے۔SARS-CoV-2 BGI پرکھ، ڈین جین پرکھ، اور سنسور بائیوٹیک پرکھ کا استعمال کرتے ہوئے ABI 7500 تھرمل سائیکلر کا استعمال کرتے ہوئے دستی طور پر نکالے گئے ایلیویٹس کو بڑھایا گیا اور ان کا پتہ لگایا گیا۔
SARS-CoV-2 وائرل RNA کی خودکار تنہائی اور تطہیر ایبٹ DNA نمونے کی تیاری کے ری ایجنٹس کا استعمال کرتے ہوئے مقناطیسی مالا کے اصول کی پیروی کرتی ہے۔نمونوں کو غیر فعال کرنا اور وائرل ذرات کو گھلنشیل کرنا ایک ڈٹرجنٹ کا استعمال کرتے ہوئے کیا جاتا ہے جس میں guanidine isothiocyanate پروٹین کو ختم کرنے اور RNase کو غیر فعال کرنے کے لیے کیا جاتا ہے۔پھر RNA کو سلیکا کا استعمال کرتے ہوئے ٹھوس مرحلے کی علیحدگی کے ذریعے پروٹین سے الگ کیا جاتا ہے، یعنی guanidinium نمک اور lysis بفر کا alkaline pH سلیکا (SiO2) سے نیوکلک ایسڈ کے پابند ہونے کو فروغ دیتا ہے۔کلی کرنے کا مرحلہ ایک واضح حل پیدا کرنے کے لیے باقی پروٹین اور ملبے کو ہٹاتا ہے۔شفاف آر این اے کو آلے کی مقناطیسی فیلڈ 20,21 کا استعمال کرتے ہوئے سلیکا پر مبنی مائکرو پارٹیکلز سے الگ تھلگ کیا جاتا ہے۔دوسری طرف، آر این اے کی دستی تنہائی اور تطہیر مقناطیسی اسٹینڈ کی بجائے سینٹرفیوگریشن کا استعمال کرتے ہوئے اسپن کالم کے طریقہ کار کے ذریعے کی جاتی ہے اور ایلیونٹ سے مائیکرو پارٹیکلز کی علیحدگی ہوتی ہے۔
ایبٹ ریئل ٹائم SARS-CoV-2 کا پتہ لگانے کا ٹیسٹ (Abbott Molecular, Inc.) کارخانہ دار کی ہدایات کے مطابق کیا گیا تھا، جسے WHO اور FDA سے EUA19,22 موصول ہوا تھا۔اس پروٹوکول میں، نکالنے سے پہلے نمونے کو غیر فعال کرنا پانی کے غسل میں 56 ° C پر 30 منٹ کے لیے کیا گیا تھا۔وائرس کے غیر فعال ہونے کے بعد، ایبٹ ایم 2000 ڈی این اے نمونے کی تیاری کے نظام کا استعمال کرتے ہوئے 0.5 ملی لیٹر VTM سے ایبٹ m2000 SP آلے پر نیوکلک ایسڈ نکالا گیا۔کارخانہ دار کے مطابق.ایک Abbott m2000 RT-PCR آلہ کا استعمال کرتے ہوئے پروردن اور پتہ لگانے کی کارکردگی کا مظاہرہ کیا گیا تھا، اور RdRp اور N جینوں کے لئے دوہری کھوج کی گئی تھی۔ROX) اور VIC P (پراپرائٹری ڈائی) کو نشانہ بنانے اور اندرونی کنٹرولوں کا پتہ لگانے کے لیے، دونوں ایمپلیفیکیشن مصنوعات کا بیک وقت پتہ لگانے کی اجازت دیتا ہے 19۔
اس کٹ کا ایمپلیفیکیشن پتہ لگانے کا طریقہ ایک قدمی RT-PCR ٹیکنالوجی پر مبنی ہے۔ORF1a/b اور N جینز کو ڈان جین ٹکنالوجی نے ٹارگٹ ریجن ایمپلیفیکیشن کا پتہ لگانے کے لیے محفوظ علاقوں کے طور پر منتخب کیا تھا۔مخصوص پرائمر اور فلوروسینٹ پروبس (N جین پروبس جن پر FAM کا لیبل لگا ہوا ہے، ORF1a/b پروبس پر VIC کا لیبل لگا ہوا ہے) کو نمونوں میں SARS-CoV-2 RNA کا پتہ لگانے کے لیے ڈیزائن کیا گیا ہے۔حتمی ایلیونٹ اور ماسٹر مکسز کو 25 µl کے حتمی والیوم میں ماسٹر مکس کے 20 µl ایلیونٹ کے 5 µl کو شامل کرکے تیار کیا گیا تھا۔ABI 750024 ریئل ٹائم پی سی آر آلے پر ایمپلیفیکیشن اور پتہ لگانے کا کام بیک وقت کیا گیا۔
ORF1a/b اور N جینز کا پتہ Sansure Biotech nCoV-2019 نیوکلک ایسڈ ڈائیگنوسٹک کٹ (فلوریسنٹ پی سی آر ڈیٹیکشن) کا استعمال کرتے ہوئے کیا گیا۔ORF1a/b خطے کے لیے FAM چینل اور N جین کے لیے ROX چینل کو منتخب کر کے ہر ہدف کے جین کے لیے مخصوص تحقیقات تیار کریں۔اس پرکھ کٹ میں ایلیونٹ اور ماسٹر مکس ریجنٹس کو اس طرح شامل کیا گیا ہے: 30 µl ماسٹر مکس ریجنٹ اور 20 µl ایلیوٹڈ نمونہ کا پتہ لگانے/پروردن کے لیے تیار کریں۔ریئل ٹائم پی سی آر اے بی آئی 750025 ایمپلیفیکیشن/پتہ لگانے کے لیے استعمال کیا گیا تھا۔
SARS-CoV-2 BGI ٹیسٹ COVID-19 کی تشخیص کے لیے ایک فلوروسینٹ ریئل ٹائم rRT-PCR کٹ ہے۔ہدف کا علاقہ SARS-CoV-2 جینوم کے ORF1a/b خطے میں واقع ہے، جو کہ واحد جین کا پتہ لگانے کا طریقہ ہے۔اس کے علاوہ، انسانی ہاؤس کیپنگ جین β-actin ایک اندرونی طور پر ریگولیٹڈ ٹارگٹ جین ہے۔ماسٹر مکس کو 20 µl ماسٹر مکس ریجنٹ اور 10 µl نکالے گئے RNA نمونے کو اچھی طرح سے پلیٹ 26 میں ملا کر تیار کیا جاتا ہے۔ایک ABI 7500 فلوروسینٹ مقداری ریئل ٹائم پی سی آر آلہ وسعت اور پتہ لگانے کے لیے استعمال کیا گیا تھا۔تمام نیوکلک ایسڈ ایمپلیفیکیشن، ہر پرکھ کے لیے پی سی آر چلانے کے حالات، اور نتائج کی تشریح متعلقہ مینوفیکچرر کی ہدایات کے مطابق کی گئی تھی (ٹیبل 3)۔
اس تقابلی تجزیے میں، ہم نے چار تجزیوں کے لیے فیصد معاہدے (مثبت، منفی، اور مجموعی) اور دیگر موازنہ کے پیرامیٹرز کا تعین کرنے کے لیے حوالہ معیاری طریقہ استعمال نہیں کیا۔ہر ٹیسٹ کا موازنہ CRS کے ساتھ کیا گیا تھا، اس مطالعہ میں CRS کو اصول "کسی بھی مثبت" کے ذریعے سیٹ کیا گیا تھا اور نتیجہ کا تعین کسی ایک ٹیسٹ سے نہیں، ہم نے کم از کم دو مماثل ٹیسٹ کے نتائج کا استعمال کیا۔اس کے علاوہ، COVID-19 ٹرانسمیشن کی صورت میں، جھوٹے منفی نتائج جھوٹے مثبت نتائج سے زیادہ خطرناک ہوتے ہیں۔اس لیے، CRS کے نتیجے سے جتنا ممکن ہو "مثبت" کہنے کے لیے، کم از کم دو پرکھ کے ٹیسٹ مثبت ہونے چاہئیں، یعنی EUA پرکھ سے کم از کم ایک مثبت نتیجہ آنے کا امکان ہے۔اس طرح، چار ٹیسٹ کے نتائج میں سے، ایک ہی نتیجہ دینے والے دو یا زیادہ ٹیسٹ کے نتائج کو صحیح مثبت یا منفی 18,27 سمجھا جاتا ہے۔
ڈیٹا کو سٹرکچرڈ ڈیٹا نکالنے کے فارمز کا استعمال کرتے ہوئے اکٹھا کیا گیا، ڈیٹا کا اندراج اور تجزیہ ایکسل شماریاتی سافٹ ویئر اور وضاحتی اعدادوشمار کے لیے SPSS ورژن 23.0 کا استعمال کرتے ہوئے کیا گیا۔مثبت، منفی، اور مجموعی فیصد معاہدے کا تجزیہ کیا گیا، اور CRS کے ساتھ ہر طریقہ کے معاہدے کی ڈگری کا تعین کرنے کے لیے ایک کاپا سکور استعمال کیا گیا۔کاپا کی اقدار کی تشریح اس طرح کی جاتی ہے: ہلکے معاہدے کے لیے 0.01 سے 0.20، عمومی معاہدے کے لیے 0.21 سے 0.40، اعتدال پسند معاہدے کے لیے 0.41-0.60، بڑے معاہدے کے لیے 0.61-0.80 اور مکمل معاہدے کے لیے 0.81-0.99۔
ایتھیکل کلیئرنس ادیس ابابا یونیورسٹی سے حاصل کی گئی تھی اور اس مطالعے کے لیے تمام تجرباتی پروٹوکولز کو ایتھوپیا کے پبلک ہیلتھ انسٹی ٹیوٹ کے سائنسی اخلاقیات کے جائزہ بورڈ نے منظور کیا تھا۔EPHI اخلاقیات لائسنس کا حوالہ نمبر EPHI/IRB-279-2020 ہے۔تمام طریقوں کا اطلاق COVID-19 کے علاج کے لیے ایتھوپیا کے قومی جامع رہنما خطوط کی سفارشات اور دفعات کے مطابق کیا گیا تھا۔اس کے علاوہ، مطالعہ میں شرکت سے پہلے تمام مطالعہ کے شرکاء سے تحریری باخبر رضامندی حاصل کی گئی تھی۔
اس مطالعہ میں حاصل کردہ یا تجزیہ کردہ تمام ڈیٹا اس شائع شدہ مضمون میں شامل ہیں۔اس مطالعہ کے نتائج کی حمایت کرنے والا ڈیٹا متعلقہ مصنف سے معقول درخواست پر دستیاب ہے۔
عالمی ادارہ صحت.COVID-19 کے لیے لیبارٹری ٹیسٹنگ کی حکمت عملیوں کے لیے سفارشات: عبوری رہنمائی، 21 مارچ 2020 نمبر WHO/2019-nCoV/lab_testing/2020.1 (WHO، 2020)۔
Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 ایمرجنسی ڈیپارٹمنٹ میں سمارٹ تشخیص: عملی طور پر سب۔ Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 ایمرجنسی ڈیپارٹمنٹ میں سمارٹ تشخیص: عملی طور پر سب۔Muliou, DS, Pantazopoulos, I. اور Gurgulianis, KI ایمرجنسی ڈیپارٹمنٹ میں COVID-19 کی ذہین تشخیص: عملی طور پر سب کچھ۔Muliou DS، Pantazopoulos I. اور Gurgulyanis KI ہنگامی محکموں میں COVID-19 کی ذہین تشخیص: عملی طور پر آخر سے آخر تک انضمام۔ماہر ریورنڈ ریسپائر۔دوائی.3، 263–272 (2022)۔
مچل، SL اور سینٹ جارج، K. COVID19 ID NOW EUA پرکھ کی تشخیص۔ مچل، SL اور سینٹ جارج، K. COVID19 ID NOW EUA پرکھ کی تشخیص۔مچل، SL اور سینٹ جارج، K. COVID19 ID NOW EUA پرکھ کی تشخیص۔مچل SL اور سینٹ جارج K. COVID19 ID NOW EUA پرکھ کی تشخیص۔J. کلینیکلوائرس.128، 104429۔ https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020)۔
ڈبلیو ایچ او.مشتبہ انسانی بیماری میں کورونا وائرس بیماری 2019 (COVID-19) کا لیبارٹری پتہ لگانا۔https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (15 اگست 2020 تک رسائی) (WHO، 2020)۔
Udugama، B. et al.COVID-19 کی تشخیص: بیماریاں اور جانچ کے اوزار۔ACS نینو 14(4), 3822–3835 (2020)۔
سید ایس وغیرہ۔مشرقی، وسطی اور جنوبی افریقہ کے پیتھالوجسٹ کے کالج کا قیام - مشرق وسطی اور جنوبی افریقہ کے پیتھالوجی کے علاقائی اسکول۔افریقہجے لیبدوائی.9(1)، 1-8 (2020)۔
ایتھوپیا انسٹی ٹیوٹ آف پبلک ہیلتھ، وفاقی وزارت صحت۔COVID-19 کی لیبارٹری تشخیص کے لیے عبوری قومی حکمت عملی اور رہنمائی۔https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/EPHI_PHEOC_COVID-19_Laboratory_Diagnosis_Eng.pdf (12 اگست 2020 تک رسائی) (EPHI، 2020)۔
وولوشین، ایس.، پٹیل، این اور کیسیل ہائیم، AS SARS-CoV-2 انفیکشن کے چیلنجز اور مضمرات کے لیے غلط منفی ٹیسٹ۔ وولوشین، ایس.، پٹیل، این اور کیسیل ہائیم، AS SARS-CoV-2 انفیکشن کے چیلنجز اور مضمرات کے لیے غلط منفی ٹیسٹ۔Voloshin S., Patel N. اور Kesselheim AS SARS-CoV-2 انفیکشنز اور ان کے نتائج کے لیے غلط-منفی ٹیسٹ۔Voloshin S., Patel N. اور Kesselheim AS اشتعال انگیزی اور SARS-CoV-2 انفیکشن کے اثرات کے لیے غلط-منفی ٹیسٹ۔N. eng.J. میڈیسن۔383(6), e38 (2020)۔
Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI جھوٹے-مثبت اور جھوٹے-منفی COVID-19 کیسز: سانس کی روک تھام اور انتظامی حکمت عملی، ویکسینیشن، اور مزید نقطہ نظر۔ Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI جھوٹے-مثبت اور جھوٹے-منفی COVID-19 کیسز: سانس کی روک تھام اور انتظامی حکمت عملی، ویکسینیشن، اور مزید نقطہ نظر۔ Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI LOJNOPOLOJITELNYE اور ложноотрицательные случаи CoVID-19: REспираторная профилактика и стратегия, стратегиальные Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI COVID-19 کے جھوٹے مثبت اور جھوٹے منفی کیسز: سانس کی روک تھام اور علاج کی حکمت عملی، ویکسینیشن اور آگے کا راستہ۔Muliu, DS اور Gurgulianis, KI COVID-19 کے جھوٹے-مثبت اور جھوٹے-منفی کیسز: سانس کی روک تھام اور علاج، ویکسینیشن اور آگے بڑھنے کے لیے حکمت عملی۔ماہر ریورنڈ ریسپائر۔دوائی.15(8)، 993–1002 (2021)۔
Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. ایمرجنسی ڈیپارٹمنٹ میں COVID-19 کی تشخیص: درخت کو دیکھنا لیکن جنگل کو کھونا۔ Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. ایمرجنسی ڈیپارٹمنٹ میں COVID-19 کی تشخیص: درخت کو دیکھنا لیکن جنگل کو کھونا۔Mouliou, DS, Ioannis, P. and Konstantinos, G. ایمرجنسی ڈیپارٹمنٹ میں COVID-19 کی تشخیص: درخت دیکھیں، جنگل کھو دیں۔Muliou DS, Ioannis P., and Konstantinos G. ہنگامی کمروں میں COVID-19 کی تشخیص: درختوں کے لیے کافی جنگل نہیں ہے۔ظاہر ہونا۔دوائی.J. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022)۔
Degli-Angeli، E. et al.ایبٹ ریئل ٹائم SARS-CoV-2 پرکھ کی تجزیاتی اور طبی کارکردگی کی توثیق اور توثیق۔J. کلینیکلوائرس.129، 104474۔ https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020)۔
Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. روایتی RT-PCR کے ذریعے وائرس کے انفیکشن کا پتہ لگانے کے لیے COVID-19 کے مختلف جینوم ریجن سے پانچ پرائمر سیٹوں کا موازنہ۔ Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. روایتی RT-PCR کے ذریعے وائرس کے انفیکشن کا پتہ لگانے کے لیے COVID-19 کے مختلف جینوم علاقوں سے پانچ پرائمر سیٹوں کا موازنہ۔Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. اور Aflatunyan, B. روایتی RT-PCR کے ذریعے وائرل انفیکشن کا پتہ لگانے کے لیے COVID-19 جینوم کے مختلف علاقوں سے پرائمر کے پانچ سیٹوں کا موازنہ۔ Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. 比较来自COVID-19 Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. روایتی RT-PCR کے ذریعے وائرل انفیکشن کا پتہ لگانے کے لیے COVID-19 کے 5 مختلف جینیاتی علاقوں کا موازنہ۔Mollaei HR، Afshar AA، Kalantar-Neyestanaki D، Fazlalipour M. اور Aflatunyan B. روایتی RT-PCR کے ذریعے وائرل انفیکشن کا پتہ لگانے کے لیے COVID-19 جینوم کے مختلف علاقوں سے پرائمر کے پانچ سیٹوں کا موازنہ۔ایرانJ. مائکرو بایولوجی۔12(3)، 185 (2020)۔
Goertzer، I. et al.SARS-CoV-2 جینوم کی ترتیب کا پتہ لگانے کے لیے قومی بیرونی معیار کی تشخیص کے پروگرام کے ابتدائی نتائج۔J. کلینیکلوائرس.129، 104537۔ https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020)۔
وانگ، ایم وغیرہ۔شدید ایکیوٹ ریسپائریٹری سنڈروم کورونا وائرس کے لیے پانچ RT-PCR کٹس کی افادیت کا تجزیاتی جائزہ 2. J. کلینیکل۔لیبارٹریمقعد35(1), e23643 (2021)۔
وانگ بی وغیرہ۔ریئل ٹائم پولیمریز چین ری ایکشن (PCR) کی بنیاد پر چین میں تجارتی طور پر دستیاب سات SARS-CoV-2 RNA ڈیٹیکشن کٹس کا جائزہ۔طبیکیمیکل۔لیبارٹریدوائی.58(9), e149–e153 (2020)۔
وین کاسٹیرن، پی بی وغیرہ۔سات کمرشل RT-PCR COVID-19 تشخیصی کٹس کا موازنہ۔J. کلینیکلوائرس.128، 104412 (2020)۔
لو، یو، وغیرہ۔SARS-CoV-2 نیوکلک ایسڈز کا پتہ لگانے کے لیے دو PCR کٹس کی تشخیصی کارکردگی کا موازنہ۔J. کلینیکللیبارٹریمقعد34(10), e23554 (2020)۔
Lefart, PR، وغیرہ۔ چار SARS-CoV-2 نیوکلک ایسڈ ایمپلیفیکیشن ٹیسٹنگ (NAAT) پلیٹ فارمز کے تقابلی مطالعے سے پتہ چلتا ہے کہ ID NOW کی کارکردگی مریض اور نمونے کی قسم کے لحاظ سے نمایاں طور پر گر گئی تھی۔تشخیصمائکرو بایولوجیمتاثر کرنا۔diss99(1)، 115200 (2021)۔
ایبٹ مالیکیول۔ایبٹ ریئل ٹائم SARS-CoV-2 تجزیہ پیکیج داخل کریں۔https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/RealTime-SARS-CoV-2-Assay۔1-12۔(10 اگست 2020 تک) (2020)۔
کلین، ایس وغیرہ۔RT-qPCR اور RT-LAMP کے ذریعے تیزی سے بڑے پیمانے پر پتہ لگانے کے لیے مقناطیسی موتیوں کا استعمال کرتے ہوئے SARS-CoV-2 RNA تنہائی۔وائرس 12(8), 863 (2020)۔